De lá para cá, o São Paulo disputou 11 jogos, mas Hernanes foi relacionado em apenas quatro partidas, diante de Atlético-GO, Ceará, Corinthians e Red Bull Bragantino. O jogador ficou um período afastado dos treinamentos devido a uma lesão muscular no tronco. 

Com contrato até o final desta temporada, Hernanes não vem sendo muito utilizado pela comissão técnica de Crespo, até por conta das lesões. Até agora foram duas: lesão na panturrilha direita - seis jogos - e contratura muscular no tronco - cinco jogos. Nesta temporada, foram apenas nove partidas, com uma assistência e nenhum gol marcado.